万分危急之时，正在巡逻的帕特拉听到动静，带着他的野蛮战士们从密林中冲了出来，掩护着众人向密林撤去。几番缠斗之后，首领们也带着各自的精锐战士们赶到，扑杀了追击而来的异种。
回到米里兰达的众人把从特拉克斯那里知道的情况告诉了首领们，当前的情况对特拉尔们十分不利。数量上的悬殊使得特拉尔们不能主动出击，然而由于菲比的擅自行动，菲拉密们又已经知道了特拉尔的归来，找到他们的隐藏地只是时间的问题。
这个时候，莲提出他可以布置下一个大型的仙法，让海洋漫过陆地，彻底消灭整个菲拉密种族，而特拉尔们则可以借助大船巴哈姆特躲过这个灾难。但是这个仙法需要巨大的能量支持，只有找到遗失的黑锤，借助六把神器和他的仙笛才能施放成功。
特拉克斯则告诉众人黑锤在帝王扎卡姆的手中，它正是借助了黑锤的力量才得以树立威望。这个消息再一次让众人陷入了忧虑之中，如何从菲拉密王者的手中夺回黑锤，首领们想了很久也没有想出很好的办法。
工程师梅罗斯通过西斯魔盒做出了一个机械菲拉密，菲比则觉得可以用这个机械菲拉密装载几个人，潜入到扎卡姆身边，偷回黑锤。机械菲拉密只能钻进六个人，于是修斯利亚、菲比、梅罗斯、帕特拉、伊芙琳和炼金师狄菲力决定乘坐机械菲拉密，而其他人则赶往巴哈姆特逃难，莲则用隐身术跟在他们后面。
特拉克斯将伪装好的机械菲拉密带到了异种们的聚集地，特里亚斯巨峰。来到了帝王扎卡姆前，表示愿意追随扎卡姆左右，扎卡姆见到特拉克斯愿意归顺自己，十分高兴，没有注意到假菲拉密的异常。修斯利亚他们却通过机械菲拉密的窥视口偷偷的寻找着黑锤的藏匿处，发现黑锤一直被扎卡姆卷在尾巴上。
当夜晚降临，所有的菲拉密都已经睡去，除了操纵机械菲拉密的梅罗斯外，其他的首领们从机械菲拉密中钻了出来，偷偷的溜到扎卡姆的洞穴中，想要偷出黑锤索尔特。然而在偷的过程中却惊醒了扎卡姆，愤怒的扎卡姆挥舞着黑锤嚎叫着扑向首领们，首领们也凭借着神器和扎卡姆缠斗起来。特拉克斯则和驾驶着机械菲拉密的梅罗斯一起抵挡住了前来支援的扎卡姆的亲卫们。
这场战斗打的异常惨烈，整个特里亚斯巨峰都被这场战斗震的颤抖起来。扎卡姆的实力异常强大，甚至比首领们估计的还要强大，扎卡姆力大无穷，鳞片坚硬无比，尖爪锋利异常，最可怕的是，扎卡姆还有着不止一种特殊能力，火焰、毒液、寒流、闪电，似乎异种们所能拥有的可怕力量都集中到了它身上。
再借助黑锤的力量，仿若天神。众人拼尽全力，相互配合才只能勉强抵挡住扎卡姆的强烈攻击，稍不留神就会粉身碎骨。双方激战了两天一夜，首领们已经精疲力尽，却还是没有取得丝毫优势。
修斯利亚心中焦急万分，不小心被一锤击中，重伤在地。扎卡姆看到有机可趁，立刻强攻而上，想要了结修斯利亚，和修斯利亚产生情愫的菲比抢上前去想要用身体保护他。然而就连蒂亚戈长袍似乎也快抵挡不住扎卡姆疯狂的攻击。
就在万分凶险的时刻，莲忽然现身，削断了扎卡姆的尾巴，抢回了黑锤，拥有先祖拉索血脉的帕特拉拿起黑锤对着扎卡姆又是狠狠的一锤。梅罗斯和特拉克斯也从异种们的围攻中脱出身来加入了战团，扎卡姆终于在众人的合力一击下战败死去。
失去了首领的异种们暴怒的围攻而上，首领们已经没有机会逃回巴哈姆特，众人决定和菲拉密们同归于尽，于是集齐了所有神器的莲发动了准备已久的仙法。
天空中忽然乌云密布，甚至遮住了恒星的光芒，天地一边黑暗，电闪雷鸣。火山开始爆发，大地也裂开了巨口，海上狂风大作，巨浪汹涌的拍打着岸边的山峰。巴哈姆特上的特拉尔遗民们惊恐的看着这毁天灭地的景象，知道首领们已经回不来了，恐惧和伤感伴随着倾泻而下暴风雨笼罩着他们。
灾难持续了数十天才结束，被巨浪击打到残破的巴哈姆特在海上飘荡了数日，终于迎来了灾难结束后的第一缕阳光。众人欢呼着跑出船舱，来到甲板，看着新世界的景象，看着被巨大力量撕裂成数块的大陆，感慨万分。
靠岸后，目睹了末日景象的人们都认为，为他们而牺牲的首领们是父神派到他们身边来拯救他们的神明。于是梦魇骑士修斯利亚成为了正义与审判之神，精灵的菲比则被称作幸运女神，大工程师梅罗斯被称为智慧与创造之神，伊芙琳则是命运与梦境之神，狄菲力成为了生命之神，帕特拉则成为了战争之神。
人们开始膜拜失去的英雄之神们，并为他们打造了六个巨大的雕像。结束这一切后，失去领导者的特拉尔遗民们分散开来，去建设自己的家园。曾经繁荣的文明毁于一旦，很多智慧和工艺都已失传，人们只能从头开始。刚开始，在一片荒芜的大路上，人们只能像野人一样生活，很多人死在了饥饿和疾病中。数千年后，大路上开始逐渐恢复生机，重新生长出新的植物，繁殖出新的动物，分散在各地的遗民们才开始各自发展出了各自的文明和语言。
由于语言不再统一，真实的历史也早已消失，几乎已经没有人知道这个世界曾经发生过什么。大家只知道一场大灾难之后，他们才诞生到这个世界上。只有对神明的传说还流传在这个世界上。于是人们就认为是至高的父神创造了六个天神，而六个天神有创造了人类，并以此创立了圣堂教会，并在原先巨大雕像的基础上建立了大圣堂。
新的世纪从此开始。